Zespół jelita drażliwego (IBS), nawracające bóle brzucha, nudności, wymioty, wzdęcia, biegunki, nietolerancja laktozy, spadek masy ciała, otyłość, nawracające afty, zapalenie kącików ust i języka, opryszczkowe zapalenie skóry, anemia z niedoboru żelaza oporna na leczenie, depresja, zmęczenie, bóle mięśni i stawów, osteopenia, osteoporoza, zatrzymanie miesiączkowania, poronienia, bezpłodność.
Choroby towarzyszące (tzw. zespoły nakładania): reumatoidalne zapalenie stawów, cukrzyca, niedoczynność tarczycy, nieswoiste zapalenie jelit, autoimmunologiczne zapalanie wątroby i inne schorzenia autoimmunologiczne, chłoniaki nieziarnicze (nowotwór),
W badaniach pomocniczych: niedokrwistość, niedobór białka w surowicy, zwiększona aktywność aminotransferaz (AST, ALT).